Maulana Habib Muhammad Luthfi bin Yahya dilahirkan di Pekalongan pada hari Senin, pagi tanggal 27 Rajab tahun 1367 H yang bertepatan tanggal 10 November, tahun 1947 M. Dilahirkan dari seorang syarifah, yang memiliki nama dan nasab:
Sayidah alKarimah as Syarifah Nur binti Sayid Muhsin bin Sayid Salim bin Syarifah Nur binti Sayid Muhsin bin Sayid Hasan bin Sasyid Imam A’lawi bin Sayid al Imam Muhammad bin al Imam ‘Alawi bin Imam al kabir Sayid Abdullah bin Imam Salim bin Imam Muhammad bin Sayid Sahal bin Imam Abd Rahman Maulana Dawileh bin Imam ‘Ali bin Imam ‘Alawi bin Sayidina Imam al Faqih al Muqadam bin ‘Ali Ba Alawi.
Sementara nasab beliau dari jalur ayah:
Al-Habib Muhammad Luthfi bin Al-Habib Ali bin Al-Habib Hasyim bin Al-Habib Umar bin Al-Habib Thoha bin Al-Habib Muhammad bin Al-Habib Syekh bin Al-Habib Ahmad bin Al-Imam Yahya Ba’Alawy bin Al-Habib Hasan bin Al-Habib Alwy bin Al-Habib Ali bin Imam Alwy an-Nasiq bin Imam Muhammad Maulad Dawileh bin Imam Ali Maula Darrak bin Imam Alwy al-Ghuyyur bin Imam Al-Faqih al-Muqaddam Muhammad Ba’Alawy bin Imam Ali bin Muhammad Shahib Marbath bin Imam Ali Khali Qasam Bin Imam Alwy bin Imam Muhammad bin Imam Alwy Ba’Alawy bin Imam Ubaidullah bin Imam Ahmad Alwy Ba’Alawy bin Imam Ubaidullah bin Imam Ahmad Al-Muhajir bin Imam Isa an-Naqib ar-Rumi bin Imam Muhammad an-Naqib bin Imam Ali al-Uraidhi bin Imam Ja’far Shadiq bin Imam Muhammad al-Baqir bin Imam Ali Zainal Abidin bin Imam Husein Ash-Sibth bin Amirul mukminin Ali bin Abi Thalib dan Sayyidatina Fathimah Azzahro binti Muhammad Rasulullah Saw.
Segudang jabatan yang diemban beliau, tidak membuat Habib Luthi merasa capek dan merasa berat memikul amanah.
Habib Luthfi bin Ali Yahya pernah dipercaya menjabat sebagai Ketua Umum MUI kota Pekalongan untuk yang kedua kalinya dan sebagai Ketua Umum MUI Jawa Tengah.
Disamping beliau seorang Mursyid Thoriqoh Sadzaliyah, juga sebagai Rais Aam dari Jam’iyyah Ahlit Thoriq Al-Mu’tabaroh An Nahdiyyah hasil Muktamar (konferensi, rapat, atau perundingan) Thariqoh ke-9 dan ke-10 yang digelar di kota Pekalongan (salah satu Badan Otonom NU).
Karya-karya Beliau
Ada beberapa penulis ketahui terkait karya-karya Habib Lutfi bin Yahya, diantaranya :
Anwar al-Nujum : Kitab Tafsir Biografi Nabi , Kitab ini beliau tulis pada akhir tahun 1980-an atau awal tahun 1990-an. Beliau mengatakan jika kitab “Anwar al-Nujum†ini belum selesai. Kitab ini secara umum memberikan penjelasan (tafsir) atas Qs. At-Taubah ayat 128, yang berbunyi :
