Sebelum ditunjuk menjadi menteri, ia adalah peneliti di Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI). DR. Muhammad A.S. Hikam, MA., APU beristrikan Ir. Puji Winarni, MA., dikaruniai seorang Anak.
Saat ini dia mengajar di Jurusan Hubungan Internasional, Fakultas Humaniora di President University.
Dia juga menjabat sebagai Penasihat Kebijakan (Policy Adviser) di Badan Intelijen Negara.
Selain itu dia juga mengajar di Sekolah Tinggi Intelijen Negara, Sekolah Staf dan Komando Angkatan Laut, Sekolah Staf dan Komando Angkatan Darat, dan Sekolah Staf dan Komando Angkatan Udara. (tim)